编制效仿美军从公开情况看，倒计菲律宾网络司令部设司令、副司令和参谋长各1人，直属武装力量总参谋部。

该司令部下辖网络任务大队、时苹士康深圳电子战和信息大队、通信系统大队、总部保障大队和网络卓越中心，以及8个网络作战大队，总人数接近1300人。

网络任务大队主要负责网络安全防护和情报侦搜工作，果代工厂工厂包括网络防渗透、取证和溯源、网络攻防武器研发、网络病毒查杀、情报获取分析等。

通信系统大队主要承担通信安全防护，火力其中手机等移动端的安全由该部门负责。

电子战和信息大队负责电磁频谱管理等工作，全开后期扩编后将“独立成军”，并组建所谓心理和舆情宣传大队。

总部保障大队主要负责预算制定和分配，备货以及相关部门的运行保障。